フォーラムへの返信

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  • 返信先: 富岳でのMD.shエラーについて #3889
    藤原 維吹
    参加者

    奥脇様

     

    大阪公立大学大学院の藤原維吹です。

    富岳のGROMACS実行について補足して説明してくださり、ありがとうございました。

     

    今後の計算時の参考にさせていただきます。

    返信先: 富岳でのMD.shエラーについて #3869
    藤原 維吹
    参加者

    大山先生

     

    すぐに返信して頂きありがとうございました。

    教えて頂いた通りにコマンドを入力しましたが、そもそもspackファイルがないというエラーが出てきました。その時のメッセージを画像で添付しています。

    Spackファイルの問題が解決できたかどうかはわかりませんが、阪大の宮川さんからのアドバイスで、「spack load gromacs@2022.4」を「spack load gromacs@2021.5」に書き換えるとMD計算が実行されました。

     

    お忙しい中、ご回答頂きありがとうございました。

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    返信先: MOEのインストールについて #3620
    藤原 維吹
    参加者

    渡邉様

    返信してくださりありがとうございました。

    MOEの代わりにすでに研究室で購入した分子モデリングソフトがあるので、そちらでやってみようと思います。

    BioStation ViewerとABINIT-MPについてはインストールが出来て、最近使い始めました。これから色々と試してみようと思います。

     

    お忙しいところ、ご教授いただきありがとうございました。

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